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新基因測序方法更精確分析單細胞
[2012/9/3]
受限于現有技術的發展,對于單細胞水平的基因特性分析是生物學家和基因學家的長期夢想。近日,來自瑞典和美國的研究團隊發明一種被稱為“智能測序(SMART-SEQ)”基因測序方法用于輔助科學家對臨床相關的單細胞進行更精確分析,這對于研究腫瘤發展的復雜進程和治致病機理具有重要意義。
此前的研究顯示,單基因能夠通過對原始部分進行不同的剪切和粘貼改變其結構,形成同類蛋白質的不同表現形式。這種被稱為“拼接(splicing)”的現象表明來自相同組織的細胞不一定同質。本項研究則開發出一種將單個細胞的基因表達進行完全解析,通過顯示活躍的細胞,有可能精確描述來自相同組織的單個細胞基因表達的不同之處。
這一技術可有多種應用,如可研究單個患者腫瘤的細胞分型。研究人員對于多發性惡性黑色素瘤患者的血液系統腫瘤細胞進行研究。一旦在常規血檢中發現腫瘤細胞后,就用“智能測序(SMART-SEQ)”方法分析其基因表達。通過這種方法證明,癌細胞已經激活對維持其能力至關重要的膜蛋白,以使癌細胞能夠逃避人體的監控系統,在血液或淋巴中傳播。
該項目是由歐洲研究理事會出資支持的單細胞基因學研究項目支持,將持續到2015年,主要目標是更好地了解多能干細胞的體內分化期間的基因表達調控,具有重要的生物學和醫學影響。雖然目前該研究僅得到初步結果,但至少表明有可能針對單個臨床診斷相關的細胞進行分析,使癌癥研究人員能夠對于細胞進行系統分析,為未來開發出更好的診斷和治療方法鋪平道路。
此前的研究顯示,單基因能夠通過對原始部分進行不同的剪切和粘貼改變其結構,形成同類蛋白質的不同表現形式。這種被稱為“拼接(splicing)”的現象表明來自相同組織的細胞不一定同質。本項研究則開發出一種將單個細胞的基因表達進行完全解析,通過顯示活躍的細胞,有可能精確描述來自相同組織的單個細胞基因表達的不同之處。
這一技術可有多種應用,如可研究單個患者腫瘤的細胞分型。研究人員對于多發性惡性黑色素瘤患者的血液系統腫瘤細胞進行研究。一旦在常規血檢中發現腫瘤細胞后,就用“智能測序(SMART-SEQ)”方法分析其基因表達。通過這種方法證明,癌細胞已經激活對維持其能力至關重要的膜蛋白,以使癌細胞能夠逃避人體的監控系統,在血液或淋巴中傳播。
該項目是由歐洲研究理事會出資支持的單細胞基因學研究項目支持,將持續到2015年,主要目標是更好地了解多能干細胞的體內分化期間的基因表達調控,具有重要的生物學和醫學影響。雖然目前該研究僅得到初步結果,但至少表明有可能針對單個臨床診斷相關的細胞進行分析,使癌癥研究人員能夠對于細胞進行系統分析,為未來開發出更好的診斷和治療方法鋪平道路。
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