核磁共振不同于X線（拍片）、CT檢查，它不帶有放射性，因此是不會產生影響身體健康的電離輻射。核磁共振成像的“核”指的是存在于人體自身組織水分子中的氫原子核。人體各種組織含有大量的水和碳氫化合物，所以氫核的核磁共振靈活度高，且氫核的磁旋比大，信號強，這是人們首選氫核作為人體成像元素的原因。雖然核磁共振沒有電離輻射，但需要指出的是，核磁共振進行檢查時需要發出電磁波（類似手機通訊狀態），不過到目前為止，還沒有證據顯示核磁共振發出的這種電磁波對人體有任何傷害。