化驗室離子色譜儀分類有多種。

1、按固定相和流動相的極性大小可分：正相化驗室離子色譜儀和反相化驗室離子色譜儀。

2、按功能可分：分析型化驗室離子色譜儀和制備型化驗室離子色譜儀。

3、按分離規模可分：小型化驗室離子色譜儀和大型化驗室離子色譜儀。

4、按分離對象的屬性可分：有機化驗室離子色譜儀和無機化驗室離子色譜儀。

5、按用途可分：生物色譜儀、制藥色譜儀、化工色譜儀、食品色譜儀、蛋白質色譜儀、氨基酸色譜儀、淀粉色譜儀、發酵液色譜儀、酵母色譜儀、催化劑色譜儀、試劑色譜儀和專用色譜儀等。