環保部指出，上述經費中，中央財政需補助1.04億元，地方需配套2.5億元。東部、中部、西部地區中央財政補助比例分別為20%、31%、41%。環保部表示，國控重點污染源監督性監測是減排“三大體系”建設的重要內容之一。隨著工作的不斷深入，目前國控重點污染源監督性監測已經逐漸常態化。

　　環保部要求，各級環境監測站應對國控重點污染源開展監督性監測。其中，對污水處理廠以及化學需氧量(COD)、氨氮重點總量減排環保工程及納入年度減排計劃的重點項目，同時監測化學需氧量(COD)、氨氮的去除效率。此外，重點監測二氧化硫、氮氧化物總量減排重點環保工程設施。

　　國務院此前公布《“十二五”節能減排綜合性工作方案》(國發〔2011〕26號)，環保部等四部委也聯合印發了《關于印發“十二五”主要污染物總量減排統計、監測辦法的通知》(環發〔2013〕14號)，上述文件均對國控重點污染源的監督性監測工作作出了要求。

　　《2013年第二批中央財政主要污染物減排專項資金項目建設方案》(下稱《方案》)指出，項目總體建設目標旨在貫徹“十二五”環境環保任務需求，提升中央本級應急指揮能力，以及提高環境監管能力。

　　國控重點污染源監督性監測是減排“三大體系”(指減排統計系統、監測系統和考核系統)建設的重要內容之一，也是該《方案》中央財政出資最多的一個項目。此次中央財政將安排財政補助預算10406萬元用于國控重點污染源監督性監測運行，約占2013年國控重點污染源四項主要污染物監督性監測運行經費總額的29.36%。

　　《方案》表明，國控重點污染源監督性監測運行項目支持范圍涉及全國32個省級環境監測站和329個地市級環境監測站，共計361個環境監測站。該項目主要開展國控廢水重點源及污水處理廠、廢氣重點源等污染物排放監測;自動設備監測的對比監測以及污染源監督性監測數據管理與報告。